据英国《每日邮报》报道，纽卡斯尔大学牙科教授西摩表示，许多漱口水中都含有酒精，有些含量高达25%。这主要是为了让漱口水中的薄荷醇、桉油精等成分发挥作用，并渗透和分解牙菌斑，但同时，酒精还会导致口腔干燥，破坏保持口腔湿润的黏液保护层，导致口气不佳，并引发刺痛感。一些漱口水还会导致牙齿变黄。
　　此外，澳大利亚牙科杂志2009年发表的研究报告显示，漱口水中的酒精会使尼古丁等致癌物，更容易渗透口腔的保护层，使癌症风险升高。
　　西摩教授建议，使用何种漱口水要听取医生的建议，例如医生可能会建议齿龈炎患者使用高氟漱口水。如果没有任何牙病，可以使用不含酒精的漱口水。另外要注意的是，漱口水中含有的去除牙菌斑成分，在10天内就可以发挥作用，不推荐长期使用
　　市面出售的漱口水有多种配方，如百里酚、三氯生、葡萄糖酸氯己定等。其中葡萄糖酸氯己定证实有效抑制牙菌膜滋长，防止牙周病，但同时发现若长期使用，会令牙渍沉积于牙齿表面，以及影响味觉。一般含有葡萄糖酸氯己定配方的漱口水，配给牙周病患者、口腔溃疡或做完口腔手术的人，但不应长期使用，避免令牙渍沉积。
　　香港卫生署表示，一般人不需要常用漱口水，只要早晚刷牙，以及使用牙线清洁已足够。部分人使用含酒精成分的漱口水，可能会感到口部、嘴唇干燥不适，甚至暂时失去味觉，建议口部常感干燥的人不要使用。
　　漱口水能清新口腔，在一定程度上除去口腔内食物残渣和部分软垢，并能暂时减少口腔内细菌的数量。漱口水的主要成分是口腔清新剂，商场或超市中出售的漱口水就是这类产品。这类漱口水的主要作用是去除口腔异味，不能把牙齿上的菌斑刷掉，一些细小的缝隙还是会残留食物，更不能起到治疗牙周病和龋齿的作用。此外，健康人的口腔里也存在一些正常菌群，不少漱口水中含有消炎成分，抑制某类口腔菌群的继续发展。在此情形下，口腔内其余菌群可能不断增多，导致天然环境下人体口腔菌群比例失调，反而不利于口腔健康。